Page 48 - No2

SZEMET GYÖNYÖRKÖDTETŐ ÉS HASZNOS

MOLEKULAGRAFIKA
MOLEKULAGRAFIKA

A molekulagrafika a számítógépek
korszerűsödésével párhuzamosan
nagyot fejlődött az utolsó két
évtizedben. Bár lehet vele
játszadozni is, és a címképhez
hasonló képeslapokat alkotni, de
a szemet gyönyörködtető ábrák
készítésénél sokkal hasznosabb
feladatokra is alkalmas. Többek
között jól használható analitikai
függvények, numerikus adatok
grafikus megjelenítésére is.

gy vegyület valódi térszerkezetére utal- hanem áttetsző, pontokból vagy rácsvonalakból igazi alakjához. De milyen lehet a „valódi” alak?
hatunk már a szokásos síkképletekben is álló is. Az egyik közelítési mód az, ha az atomokat övező
az ú.n. fel/le kötések alkalmazásával, bár A VDW felület már elég közel jár a molekula elektronok sűrűségét, pontosabban azok tartóz-
Eez inkább csak az atomcsoportok egy-
máshoz viszonyított térhelyzetét tükrözi. A mole- 1. ÁBRA
kulák valódi, háromdimenziós szerkezetének
ábrázolására régebben csak egy valóságban meg-
épített modell volt alkalmas (golyós modell,
Dreiding-modell stb.). A képernyőn ugyanerre
sokféle lehetőség létezik. A legegyszerűbb és leg-
gyorsabb a vonalas vektor modell, amiben általá-
ban a különböző atomtípusokat különböző szín-
nel szokták ábrázolni. Szemre tetszetősebb és
kivetítésre alkalmasabb az ú.n. vastag vektor
modell, ami a színezés variálásával térszerűvé,
fotorealisztikussá tehető. Ha az atomokat gömb-
szerűen ábrázoljuk, a golyósmodellhez jutunk. A
golyók mérete tetszőleges lehet, s ha azok a van
der Waals (VDW) sugárnak felelnek meg, akkor
az ú.n. térkitöltéses modellt kapjuk. (1. ábra). Ez
utóbbit kalott vagy CPK modellnek is szokták
nevezni. A VDW felület nemcsak tömör lehet, A morfin ábrázolása golyósmodellként és CPK modellel

48 I. ÉVFOLYAM 2. SZÁM, 2009 KÉMIAI PANORÁMA

9/18/09 1:57 PM
48-51 molekulagrafika.indd 48 9/18/09 1:57 PM
48-51 molekulagrafika.indd 48