Page 49 - No2

SZEMET GYÖNYÖRKÖDTETŐ ÉS HASZNOS

felületet ábrázolunk, a kapott kép annál inkább
hasonlít egy klasszikus vegyértékekkel rajzolt
A diborán molekula képlethez. A 2. ábra a diboránt (B H ) mutatja. A
2 6
nagy ill. kis klasszikus vegyértékeket használva problémás a
elektronsűrűségű szerkezet felrajzolása, így azonban az elektronsű-
helyeket leíró rűség alapján szépen látható, hogy a bóratomok
izofelületekkel közti hidrogénatomok egyformán tartoznak
ábrázolva. mindkét szomszédjukhoz, mintha kétszer
„félvegyértékűek” lennének.
A biológiailag jelentős (makro)molekulák való-
di kémiai viselkedését még jobban jellemzi az
2. ÁBRA ú.n. oldószerelérési felület. Ez azt jelzi, hogy a
molekula mely része kerülhet kapcsolatba az
é
gét
kodási valószínűségét oldószerrel. A VDW sugarú gömbökkel alkotott
k
u-
ábrázoljuk a moleku- felület ugyanis nem fedi teljesen a valóságot,
la atommagjai mert nem tűnik ki belőle, hogy a közeli „gömbök”
körül egy ú.n. közé sem az oldószer, sem a még nagyobb rea-
izofelületen (az gens molekulák nem férnek be. Így az ilyen zse-
izofelület pél- bek, rések - legalábbis a kémiai hozzáférés szem-
dául a meteo- pontjából - olyanok, mintha nem is léteznének.
rológiai térké- Főleg az össze-vissza kanyargó fehérjeláncok
pekről ismert között lehetnek ilyen „barlangszerű” üregek. A
izobárok, izo- valóságot jellemző molekulafelületet úgy kapjuk
termák térbeli meg, hogy egy, az oldószermolekula méretével
analógiája: az azo- - megegyező próbagömböt minden irányban kör-
nos tulajdonságú,
ötő
ze
értékű helyeket összekötő
s
k
g
pontok összessége. A gömb
. A
ömb
például olyan izofelület, amelynek
Az oldószerelérési és
minden pontja egyenlő távolságra van a közép-
a Conolly-felület
ponttól.). Ha az elektronsűrűségre kis értéket
létrehozása.
adunk meg, a kapott izofelület hasonló lesz a
Egy tipikus fehérje
VDW felülethez. Minél nagyobb elektronsűrűségű
oldószerelérési felülete.
3. ÁBRA

KÉMIAI PANORÁMA I. ÉVFOLYAM 2. SZÁM, 2009 49

9/18/09 1:57 PM
48-51 molekulagrafika.indd 49 9/18/09 1:57 PM
48-51 molekulagrafika.indd 49