Lehetséges magyarázat arra, hogy miért bal- vagy jobbkezesek a biomolekulák
A kémiai reakciók racém keveréket, egyenlő mennyiségű jobb- (d) és balkezes (l) enantiomer molekulát eredményeznek.  A természet azonban csak egyet választ ezek közül a „királis” molekulák közül a sejtek felépítéséhez. A homokiralitás a Föld biomolekuláinak alapvető jellemzője. A
DNS, az RNS és a cukrok építőkövei mind jobbkezesek (d), míg az élő
anyagot felépítő aminosavak és fehérjék mind balkezes enantiomerek (l).A
homokiralitás kialakulásának oka, pontos mechanizmusa még nem ismert,
bár feltárása hosszú ideje foglalkoztatja a kutatókat. Az
világos volt, hogy egy vagy több, a teljes prebiotikus hálózatban ható
környezeti hatásra van szükség, a homokiralitás létrehozása és
fenntartása érdekében is. Több
javaslat is született, melyekben környezeti hatásként elsősorban a
kozmikus sugárzást vagy polarizált fényt jelölték meg az első
biomolekulák kiralitásának kialakulásáért. Bár kísérletek igazolták,
hogy mindkét sugárzás okozhat kezdeti szimmetria torzítást, amely
bizonyos mértékben akár a jobb-, akár a balkezes molekulákat részesíti
előnyben, de arra nem adtak magyarázatot, hogy a kezdeti gyenge
aszimmetria milyen mechanizmussal erősödött meg olyan mértékben, hogy
létrejöjjön az első sejtek létrehozásához szükséges nagyszámú
homokiralis molekula. Az elmúlt két évtized kísérleti eredményei alapján, S.F.Ozturk, Z.Liu, J.D.Sutherland és D.D.Sasselov most megjelent munkájukban (Science Advances Vol 9, Issue 23) arra
a következtetésre jutottak, hogy valószínűleg a korai Földön gyakori
magnetit ásványok mágneses tere volt az a környezeti hatás, amely
felelős a biomolekulák adott kiralitásáért, pozitív visszacsatolást
létrehozva, hogy továbbra is ugyanaz a kedvezett királis enantiomer
szintézise részesüljön előnyben a teljes prebiotikus hálózatban. A
kutatók egy RNS-prekurzor, a racém ribo-amino-oxazolin (RAO),
spin-szelektív kristályosodását vizsgálva magnetit (Fe3O4) felületeken
körülbelül 60%-os enantiomer-felesleget értek el. A kezdeti dúsítást
követő többszöri újra kristályosítást követően homokirális (100%) RAO
kristályokat nyertek. Eredményeik alapján arra a következtetésre
jutottak, hogy a korai Föld sekély tavaiban, ahol gyakoriak voltak az
üledékes magnetit kristályok, teljesen racém kiindulási anyagokból
többszöri újra kristályosodással játszódhatott le a rendszerszintű
homokiralitás elérésére. A
történet 1999-re nyúlnak vissza, amikor Ron Naaman, a Weizmann
Institute of Science kémiai fizikusa által vezetett kutatócsoport
kimutatta, hogy mágnese térben a két enantiomer molekulában az
elektronok spinjei eltérően polarizáltak.Később
az is kiderült, hogy a spin-különbségek miatt a királis molekulák
eltérő módon lépnek kölcsönhatásba a mágneses anyagokkal. A kutatók úgy
találták, hogy a balkezes peptideket vonzzák a mágneses felületek, míg
a jobbkezeseket taszítják és a DNS esetében pedig éppen fordított a
helyzet.
Amikor
egy királis molekula megközelíti a ferromágneses felületet (FM) töltés
polarizáció jön létre, amelyet spin polarizáció kíséri. A
töltéspólusokhoz tartozó spinállapotot a molekula kiralitása határozza
meg. Mivel maga a ferromágneses felület is spin-polarizált, a
kölcsönhatások erősebbek, ha az FM spinjei a királis molekula pólusának
spinjével ellentétes irányban helyezkednek el. Ezért az erősebb
kölcsönhatású enantiomer hosszabb tartózkodási idővel rendelkezik a
mágneses helyen, és így nagyobb eséllyel kristályosodik, magyarázzák a
kutatók közleményükben. A
vizsgálatok megerősítették, hogy a hatást a molekulák kiralitása, az
úgynevezett kiralitás-indukált spin szelektivitás (CISS) váltja ki. A jelenség részletes ismertetését a magazin következő számában olvashatják Kedves Olvasóink.
Az AAP térszerkezete
Az
ELTE kutatói, Perczel András, és kutatótársai - Kiss Szemán Anna, Jákli
Imre, Harmat Veronika és Karancsné Menyhárd Dóra
krio-elektronmikroszkópos módszerrel 2022-ben meghatározták
egy az emberi szervezetben létfontosságú fehérje az acilaminoacil
peptidáz (AAP) térszerkezetét. Kimutatták, hogy bakteriális
fertőzések esetén gyakran használt Meropenem nevű penicilinszerű
antibiotikum gátolja az AAP működését. Az
AAP a szervezet egyik
legfontosabb lektoráló enzimje, amely katalizálja az emberi szervezet
hibásan feltekeredett és sérült fehérjéinek lebontását. A Meropenem
kötődésekor az AAP többé nem tudja ellátni katalizátor szerepét. Az AAP
gátlása során a károsodott fehérjék felhalmozódnak a s szervezetben ami
rosszindulatú átalakulásokhoz vezethet.
A
vizsgálati módszerrel, mely kidolgozásáért 2017-ben J. Dubochet, J.
Frank és R. henderson Nobel-díjat kaptak, ma már ugyanolyan
részletgazdag 3D kép nyerhető a molekulákról, mint a röntgendiffrakciós
módszerrel. Azonban míg a röntgendiffrakciós mérésekhez kristályos
fehérjékre van szükség, az új módszerrel a nem kristályosítható
molekulák térszerkezete is meghatározható. A krio-
elektronmikroszkópban elektronnyalábokkal pásztázva a fehérjemolekulák
vízes oldatának egy alacsony hőmérsékletre fefagyasztott cseppjét, leképezik a
molekula különböző kétdimenziós vetületeit. Ezekből a vetületekből
számítási eljárással határozható meg a fehérje háromdimenziós modellje.
A kutatócsoport eredményeit címlapján mutatta be a Royaé
Society of Chemistry Chemical Science megnevezésű folyóírata. Chem. Sci., 13, 14264 (2022)
|